岐阜县位于县北部的飞弹地区，有御岳山、乘鞍岳、奥穂高岳等海拔超过3000米的群山连绵不断。而位于南部的美浓地区，有木曽三河（即,木曽河、长良河、揖斐河）流淌于浓尾平原之上，其中属长良川中流域水质最为清澈,被誉为“日本名水百选”之一。
　　
岐阜县因为多山，海拔相差甚大，因此县内个地区的气候也有很大的差异。例如,岐阜县的平均气温为15.1℃，而北部的高山市的平均气温则是10.4℃。