东京都内的交通机构，有以山手线为首的JR；东京都和帝都高速交通营团二家公司经营的地下铁；东京管和私铁巴士公司的巴士路线，三个主要部分。辅助性的交通工具有都营的路面电车（都电），以及在山手总线站发车，联络卫星城市的私铁。

JR
原本简称为国铁，因经年巨额赔损，1987年4月改组由私人经营。行驶于都中心的是山手线，这条线呈环状，将东京的重要部分绕一周。将这个环状路线贯穿而过的是中央、总武线，可达千叶、武藏野、八王子等地；另外有一条京滨东北线，部分走向与山手线一样,将南边的川崎、横滨和北边的浦和、大宫加以连接。各条路线上行驶的车辆，皆有不同颜色，山手线为绿色、中央线快速车为红色、中央慢行车及总武线为黄色、京滨东北线为蓝色，旅客若能牢记各种颜色的表示路线，更有助于乘车的方便。

地下铁
简称"营团"的帝都高速公路交通营团和简称"都营"的东京都，合起来共有10条路线，包括已有60年历史的银座线；大战后第一号开通的丸内线；年青人街、六本木及筑地两地来往的是日比谷线；可能达狄斯耐乐园的东西线；另外有千代田线、有乐町线、半藏门线；"都营"则有浅草线、三田线、及新宿线三条。

公车巴士
为填补JR及地下铁无法行驶的地区，出现了以都营为首的东急等公车巴士的路线。巴士一般而言，站和站之间距离较短，有时可在靠近目的地处下车；也可以欣赏街道风景。但东京经常塞车，所以无法控制时间。

计程车
在市内任何道路上都可随手拦截计程车，可是计费方式是采距离和所乘坐时间来算，所以遇到塞车，常会出现意想不到的价钱。还有市内道路许多地方禁止U型回转，因此除非遇到紧急状况或有把握不会塞车，否则，最好不要利用计程车，起跳费用￥600。